《大长今》结局是徐长今和闵政浩在一起了，中宗病情越来越严重，他派人把徐长今送到闵政浩被流放的地方，希望两人能够远走他乡，后来中宗驾崩，徐长今和闵政浩走到一起，两人还有了一个女儿。
徐长今希望用自己研究出来的成果帮助中宗施行手术，但其他人都不同意她这么做，这时候中宗的身体越来越糟糕，他害怕徐长今被迁怒，就让人将徐长今送到闵政浩所在的地方，让他们过平淡的日子，避免朝廷官员追杀。
中宗死后，徐长今成为通缉犯，她和闵政浩修成正果，开启来了颠沛流离的逃亡生活，皇后得知徐长今的消息后，就下令恢复徐长今和闵政浩的身份，让他们回宫廷，皇后希望徐长今能够留在宫中，可是徐长今最后选择与闵政浩离开，做一对普通的夫妻，带着女儿幸福的生活下去。
