《湄公河大案》结局是莫雄被抓判死刑，蒙洪跳崖后在医院救治，苏沃和坎兰交待过往罪行，石桥被刘卫东打死，而刘卫东在逃跑过程被抓，王海峰完成任务后离开了云南。
中国13名船员在泰国被枪杀，警方接到报警之后迅速的成立专案小组赶到云南处理这起案件。在这个过程中意外发现隐匿在此的贩毒团伙，中国警方决定潜入金三角揪出幕后黑手。
在真相就要水落石出的时候，其他犯罪团伙纷纷感到害怕，决定主动交待自己的罪行，但莫雄却始终不承认自己犯下的罪名，江海峰将掌握的证据和莫雄犯下的罪过全部讲给他听，最终莫雄崩溃，在审讯室中莫雄被一点点的击垮，最终承认罪行，被判处了死刑。
本剧情根据真实故事改编，看的观众热血沸腾，看到案件得到了解决，还给受害者公道，身为一名中国人感到无比的自豪。
